大批漢人移民進入台灣之後，荷蘭人向台灣人抽稅，這是移民所無法接受的事。漢人由大陸移民台灣本來就是無法忍受大陸沿海的戰亂與飢荒以及官府的重稅，才會千辛萬苦，渡海來台灣，想不到，荷蘭人竟然以統治者的姿態，制定法律扣重稅。獵戶必須向荷蘭人申請打獵執照，而漢民卻是必須交出收入的百分之十的高稅，這樣的管制，越來越引起移民的憤怒與不滿，於是有一部份的移民消極抵抗不顧荷蘭人的法規，私有打獵掠魚或是走私。
被荷蘭人發現了之後，竟然將他們抓起來，並且處死刑，這在漢族移民中，引起莫大反抗荷蘭人的情緒，移民與荷蘭人的衝突已經到緊張的地步，荷蘭人也開始發覺移民的不滿情緒，危機暗伏情勢是十分不利。
終於在一六五二年（順治九年，永曆六年），爆發了郭懷一的抗暴事件。
郭懷一原本是鄭芝龍的部下，鄭芝龍接受明朝的招安之後，郭懷一留在台灣單獨奮鬥，帶領二、三千人，成為一位受移民敬重的領袖人物，他一直在赤崁南方的二層行溪一代耕作，他個性忠厚又樸實，而且疏財仗義，慷慨助人，一直受人尊重。郭懷一聽著移民的訴苦，知道荷蘭人對移民之種種的欺壓殘忍，使得郭懷一他無法忍受了，他認為，辛苦渡海來台灣，不是要來讓荷蘭人統治、壓迫的，便決定要起來反抗。
就在一九五二年九月七日，他聚集了手下及崇拜他的群眾，在他的屋內，秘密商議中秋夜起義的計劃。
大家皆表示贊成，誰知，郭懷一的小弟卻是貪生怕死，竟然偷偷逃到熱蘭遮城向荷蘭人密告。 荷蘭人大驚，卻又半信半疑，因為在荷蘭當局的印象中，郭懷一平常與荷蘭人是和平共處，並無發生過衝突，這種人哪有可能密謀造反？而在荷蘭人當局懷疑的時候，郭懷一已經發動猛烈的攻擊，一萬六千人攻向赤崁樓。