接任劉銘傳的第二任台灣巡府是紹友濂，他只是奉命來台灣執事，並無心為台灣建設，他甚至認為劉銘傳為了台灣太過大費周章、勞民傷財，於是以休養民力為理由，將劉銘傳的所有政策全部修改或廢除，台灣再度進入停頓的狀態，另一方面的危機是，台灣人渾然不知清朝已決心將台灣賣給外國了。
1894-1895年，中國與日本在渤海發生一場慘烈的海戰，清朝大敗，日本因此強討東北和台灣，這便是歷史上有名的甲午戰爭，邵友濂心知台灣已經無望，便將巡撫的職位讓與唐景崧，自己逃回中國大陸。
在北京的滿清政府這時已經準備將台灣和澎湖割讓給日本。 而大權在握的慈禧太后，卻對遠在大陸東南方的台灣一無所知，他要李鴻章奏上有關台灣的一切，誰知李鴻章的報告竟是十分不堪的語詞，他說：台灣是一個鳥不雨、花不香、男無情、女無義的瘴癘之地，割之可也！ 1895年（光緒21年） 4月17日，日本首相伊藤博文與清朝特使李鴻章在日本九州的馬關簽定馬關條約，將台灣、澎湖交給日本帝國，這件事根本沒和身在台灣的千萬台灣子民商討過，便妄下決斷。
悲痛的台灣人將李鴻章視為台灣最大的仇人，事實上，清朝的決定才是最大的關鍵，李鴻章不過是個執行者而已，受害的台灣人民又要向誰求助？訴苦？眼看日本大軍就要佔領台灣島，整個島嶼陷入一片愁雲慘霧中，台灣是必須要走出一個方向的時候了。